Geneesmiddelen vinden in de biomedische databerg
ArrayText mining the biomedical literature for application to drug discovery
De biomedische literatuur vormt een belangrijke bron van kennis over de functie van genen en over hoe genen cellulaire processen beïnvloeden en reguleren. Onmisbare informatie voor onderzoek naar nieuwe medicijnen, maar het vergaren van deze kennis is tijdrovend: de hoeveelheid informatie is overweldigend.
Raoul frijters automatiseerde het zoeken in biomedische literatuur. CoPub kan de benodigde, relevante informatie automatisch uit de literatuur filteren met behulp van text mining. Hij zette CoPub in voor toxiciteitsstudies om eventuele (ongewenste) bijeffecten van kandidaat medicijnen in kaart te brengen, en bleek in staat om de werkingsmechanismen voor groepen van stoffen te kunnen beschrijven. Daarnaast werd in een andere studie aangetoond dat het mogelijk is om met de CoPub database nieuwe toepassingen voor bestaande geneesmiddelen te voorspellen.
Biografie
Raoul Frijters (Etten-Leur, 1975) studeerde Biochemie aan het Hoger Laboratorium Onderwijs en werkte als research analist moleculaire biologie op de Experimentele Hepatologie afdeling gewerkt in het AMC Lever Centrum (ALC) te Amsterdam. Ondertussen deed hij een studie Hogere Informatica aan de Hogeschool van Amsterdam, gevolgd door een master Bioinformatica in Wageningen (cum laude) behaalde. Zijn promotieonderzoek bij het Centre for Molecular and Biomolecular Informatics (CMBI) van de Radboud Universiteit Nijmegen vond plaats in samenwerking met MSD (voormalig Organon en Schering-Plough). Sinds mei 2010 is Frijters werkzaam als bioinformaticus bij Skyline Diagnostics te Rotterdam, waar hij betrokken is bij het ontwikkelen van diagnostische testen voor kanker.
Datum: vrijdag 16 september 2011
Tijd10:30
Locatie: Academiezaal Aula, Comeniuslaan 2
Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica
Promovendus: de heer ir. R.J.J.M. Frijters
Promotors: prof. dr. J. de VliegCopromotorsdr. W. Alkema
Titel promotie: Text mining the biomedical literature for application to drug discovery
Bron: RU