Verblijfsvergunning van bacteriën
ArrayVoordat u begint met het lezen van het proefschrift van promovendus Miaomiao Zhou, zou u deze vier vragen moeten overwegen:
1. Eet u weleens een potje yoghurt, plakje kaas, stamppot met zuurkool?
2. Weet u dat bij elke hap hiervan een enorme hoeveelheid bacterien in uw darmen introduceert en dat deze, goedaardig of niet, lange tijd binnen uw lichaam blijven?
3. Weet u dat een van de belangrijkste factoren die beslissen over de ‘verblijfsvergunning’ van de bacterien in uw darmen, de extracellulaire en oppervlaktegeassocieerde eiwitten van deze microben zijn?
4. Gelooft u dat het mogelijk is om de locatie van deze eiwitten te voorspellen, met behulp van de genoomsequenties van de organismen?
Is het antwoord ‘Ja’ op deze vragen, dan kunt u wellicht uit de voeten met het proefschrift van Zhou. Ze beschrijft methoden voor voorspelling van de subcellulaire locatie (SCL) van bacteriele eiwitten op de schaal van het genoom, en de uitgebreide toepassing van SCL-voorspelling in combinatie met diverse heterogene bronnen van kennis. Haar proefschrift is onderdeel van het NBIC (Netherlands Bioinformatics Centre van het Netherlands Genomics Initiative) Biorange programma.
Biografie
Miaomiao Zhou (Henan, China, 1980) studeerde bioinformatica in Wageningen. Ze verrichtte haar promotieonderzoek in het Center for Molecular and Biomolecular Informatics, binnen het onderzoeksinstituut NCMLS. Sinds 2009 werkt ze als wetenschapper bij NIZO in Ede.
Datum: dinsdag 4 januari 2011
Tijd15:30
Locatie:Academiezaal Aula, Comeniuslaan 2
Faculteit der Medische Wetenschappen
Promovendus: mevrouw ir. M. Zhou
Promotors: De heer prof. dr. R.J. Siezen
Titel promotie: Genome-scale prediction of protein subcellular location in bacteria, with focus on extracellular and surface-associated proteins
Bron: RU